No exercício das suas atribuições, o INDMO acolhe parcerias e cooperação com diversas entidades públicas e privadas, tanto a nível nacional, como internacional.
As entidades nacionais e internacionais principalmente naquelas que têm como responsabilidade o desenvolvimento e o reforço do sistema da formação profissional. As entidades nacionais, tais como, os ministérios e as administrações indiretas do Estado que responsabilizam pela área de educação, formação e emprego bem como aquelas que têm como missão o desenvolvimento dos setores produtivos. Entretanto, há também as agências e organizações internacionais a nível regional que cooperam com o INDMO. Além disso, o INDMO realiza a cooperação com as agências reguladoras dos países parceiros.
Esta função decorre da alínea d) do artigo 4.º do Decreto-Lei n.º 8/2009, de 5 de março.